热带亚热带植物学报

北大核心,CA,JST,CSCD扩展版,WJCI

国内刊号:44-1374/Q

国际刊号:1005-3395

热带亚热带植物学报杂志2026年第1期:罗浮柿EST-SSR分子标记开发和种群遗传多样性评价

发布日期:

作者:汤瑞瑜,李想,黄钰琳,冯钰,张永华

单位:温州大学生命与环境科学学院, 浙江 温州 325035;重庆大学环境与生态学院, 重庆 400044,,温州大学生命与环境科学学院, 浙江 温州 325035,,温州大学生命与环境科学学院, 浙江 温州 325035,,中国科学院成都生物研究所, 成都 610041,,温州大学生命与环境科学学院, 浙江 温州 325035,

关键词:罗浮柿;引物开发;EST-SSR;遗传结构;遗传多样性

基金:国家自然科学青年基金项目(31800309);温州市基础性公益科研项目(N20240014);百山祖国家公园科学研究项目(2021KFLY06)资助

该研究基于罗浮柿(Diospyros morrisiana)幼苗转录组数据,利用CandiSSR软件开发了1 620对具有多态性的EST-SSR分子标记,并基于随机筛选的15对EST-SSR分子标记对8个天然种源地的157株罗浮柿野生植株的遗传多样性进行评价。结果表明,转录组数据集包含100 285条Unigene序列,总长为98 738 602 bp;其中含有34 121个SSR位点,发生频率为34.02%,约每2.89 kb含1个SSR位点。从中随机选择的15对具有良好多态性的EST-SSR引物,多态性信息含量(PIC)为0.244~0.877,均值为0.623,其中12个位点具有高度多态性(PIC: 0.543~0.788)。基于15对EST-SSR引物的8个罗浮柿野生种群的观测杂合度为0.503~0.650,期望杂合度为0.574~0.610,Shannon多样性指数为1.072~1.245,表现出中等遗传多样性。罗浮柿野生种群的遗传变异绝大部分在种群内(83.29%),种群间存在广泛的基因流,遗传关系较近。该研究为开展罗浮柿的种质资源评价、遗传多样性分析和分子标记辅助育种提供技术支持和科学依据。

来源:2026年第1期

《热带亚热带植物学报》期刊编辑部

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