热带亚热带植物学报

作者：黄泽铖，郭微，王龙远，李凌飞，吴伟

单位：仲恺农业工程学院园艺园林学院, 广州 510250,,仲恺农业工程学院园艺园林学院, 广州 510250,,仲恺农业工程学院园艺园林学院, 广州 510250,,仙湖植物园, 南亚热带植物多样性重点实验室, 广东 深圳 518004,,仲恺农业工程学院园艺园林学院, 广州 510250,

关键词：盾叶秋海棠;MITEs转座子;基因插入偏好;基因功能

基金：岭南特色园林观赏植物种质创新与开发应用创新团队项目(2023KCXTD017)；广东省现代农业产业技术体系创新团队建设项目(2024CXTD12)；深圳市城管局科研项目(202408)资助

利用已发表盾叶秋海棠(Begonia peltatifolia)基因组和不同组织的转录组数据，对基因组中微型重复转座子元件(MITEs)进行鉴定和分类，并对其在基因组上的分布特征、插入偏好和表达状态进行了分析。结果表明，共鉴定出925个MITEs拷贝，分属于hAT、Mutator、PIF/Harbinger和Tc1/Mariner等4个超家族，其中hAT家族占比最高，达到70.49%。插入位置分析发现，有59.5%的MITEs元件位于基因侧翼(上下游各5 kb)或基因内，其它约40%的MITEs则位于端粒、着丝粒或其它基因稀疏区域；且位于基因5′侧翼的MITEs拷贝大约是3′侧翼的MITEs的2倍，插入热点在1 000~3 000碱基对距离内，这些共转录的基因主要与次生代谢、能量合成和转运功能有关；插入到基因内部的则主要分布在非编码区(UTRs和内含子)，在外显子上没有观察到MITEs的插入，插入基因功能富集主要与功能、蛋白质合成和遗传信息的表达有关。对盾叶秋海棠不同组织的转录组数据共检测到68次MITEs共转录，在营养器官花梗和叶中极少表达。在生殖器官花和活跃分生组织的根中表达较多，且含有MITEs的转录本中，80.8%和其异构体相比，表达量降低或差别不显著，仅有19.1%的表达量增加。这为开展其耐旱的转座子表观遗传调控机制奠定了基础，为耐旱秋海棠新品种选育提供了基因资源。

来源：2025年第5期

《热带亚热带植物学报》期刊编辑部

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