国内刊号:44-1374/Q
国际刊号:1005-3395
发布日期:
作者:张文娟,谷振军,胡珊,张志红,李火根,杨春霞
单位:南京林业大学, 林木遗传与生物技术教育部重点实验室, 南方现代林业创新中心, 南京 210037,,江西省林业科学院林木遗传育种与栽培研究所, 南昌 330032,,江西省林业科学院林木遗传育种与栽培研究所, 南昌 330032,,峡江县林木良种场, 江西 吉安 331409,,南京林业大学, 林木遗传与生物技术教育部重点实验室, 南方现代林业创新中心, 南京 210037,,江西省林业科学院林木遗传育种与栽培研究所, 南昌 330032,
关键词:湿地松;松脂;转录组;产脂候选基因
基金:国家自然科学基金项目(32160389);江西林业科学院青年科技人才培养项目(2021522901)资助
为挖掘湿地松(Pinus elliottii)松脂合成相关的基因,对不同采脂期的木质部和针叶进行高通量转录组测序,与火炬松(Pinus taeda)参考基因组进行比对,共获得了68 211条unigenes,546 356 450条clean reads,平均比对率达90.21%。将不同时期木质部、木质部与针叶间进行两两对比,以P<0.05,|log2FoldChange|>1.0为标准来筛选差异基因,并进行GO和KEGG富集分析。结果表明,参与萜类物质合成的差异基因有133个,其中大部分富集在MEP途径,从差异基因中挑选8个产脂相关的候选基因进行RT-qPCR验证,确定HMGR、DXS、TPS、ABC转运蛋白基因与产脂存在关联性。通过转录组测序与分析,挖掘出133个参与松脂萜类物质合成相关的差异基因,其中萜烯合酶基因(TPS)和ABC转运基因在正调控萜类物质合成中发挥关键作用。
来源:2023年第4期
《热带亚热带植物学报》期刊编辑部