国内刊号:44-1374/Q
国际刊号:1005-3395
发布日期:
作者:李子菲,苏应娟,王艇
单位:华南农业大学生命科学学院, 广州 510642,,中山大学生命科学学院, 广州 510275;中山大学深圳研究院, 深圳 518057,,华南农业大学生命科学学院, 广州 510642,
关键词:蕨类植物;ycf94;密码子偏好性;进化速率;适应性进化
基金:国家自然科学基金项目(31770587)资助
ycf94基因是近年来在叶绿体基因组中新发现的一个基因,在蕨类植物中表现高度保守。该研究共选取94种蕨类植物,在系统发育背景下,对ycf94基因的结构特征、密码子偏好性、进化速率和适应性进化进行分析。结果表明, ycf94基因的密码子偏好性较弱,偏好使用以A/U结尾的密码子,且不同物种间的偏好性存在一定差异。密码子偏好性的形成主要受到突变压的影响,同时也存在其他因素的作用;基于凤尾蕨科和其他蕨类中ycf94基因的结构特征存在区别,对两者的分子替换速率进行了比较,表明颠换率、非同义替换率和ω值间存在显著差异;仅检测出1个正选择位点74A,强烈的负选择作用表明ycf94基因的结构和功能基本趋于稳定。这为蕨类系统发育分析提供了新依据,并提供了解析ycf94基因功能的线索。
来源:2023年第4期
《热带亚热带植物学报》期刊编辑部