热带亚热带植物学报

北大核心,CA,JST,CSCD扩展版,WJCI

国内刊号:44-1374/Q

国际刊号:1005-3395

热带亚热带植物学报杂志2023年第3期:向日葵AGO和DCL基因家族的鉴定和表达分析

发布日期:

作者:张红,员世宇,王文浩,刘文俊,何丽芬,闫玉星,王彦尊,王鹏冬,郑洪元,张鑫

单位:山西农业大学经济作物研究所, 太原 030031,,山西农业大学经济作物研究所, 太原 030031,,山西农业大学经济作物研究所, 太原 030031,,山西农业大学经济作物研究所, 太原 030031,,山西农业大学经济作物研究所, 太原 030031,,山西农业大学经济作物研究所, 太原 030031,,山西农业大学经济作物研究所, 太原 030031,,山西农业大学经济作物研究所, 太原 030031,,山西农业大学经济作物研究所, 太原 030031,,山西农业大学经济作物研究所, 太原 030031;省部共建有机旱作农业国家重点实验室(筹), 太原 030031,

关键词:RNA干扰;AGO家族;DCL家族;向日葵;基因表达

基金:山西省重点研发计划项目(201903D221088);国家特色油料产业技术体系项目(CARS-14-2-05);山西农业大学生物育种工程项目(YZGC047);山西省现代农业产业技术体系建设专项资金(2022-05)资助

为了解向日葵(Helianthus annuus)的Argonaute (AGO)和Dicer-like (DCL)的功能,利用拟南芥(Arabidopsis thaliana)的AGO和DCL基因序列在向日葵基因组数据库中进行同源比对,对向日葵AGO和DCL家族成员进行生物信息学分析。结果表明,从向日葵中鉴定到15个HaAGOs和5个HaDCLs家族成员;这2类基因在染色体上的分布均不均匀。系统发育分析表明,与拟南芥相似,HaAGO家族成员可分为3个分支,HaDCL可分为4个分支;所有的HaAGO都具有保守的N domain、DUF1785、PAZ和PIWI结构域,HaDCL家族成员都含有PAZ和RIBOc结构域。表达分析表明,HaDCL3a和HaDCL3b在茎和花序中高度表达;亚细胞定位表明HaAGO多定位于细胞核。这表明向日葵中可能存在典型的RNAi干扰机制,并可能参与了协调向日葵的生长发育过程。

来源:2023年第3期

《热带亚热带植物学报》期刊编辑部

查看热带亚热带植物学报杂志2023年第3期

联系我们

  • 地址:广东省广州市天河区兴科路中国科学院华南植物园内
  • 电话: (020)37252514
  • E-mail:jtsb@scib.ac.cn

咨询工作人员