国内刊号:44-1374/Q
国际刊号:1005-3395
发布日期:
作者:刘学锋,李小梅,张国武,张沛健,刘果,黄敏,陈银霞
单位:中国林业科学研究院速生树木研究所, 广东 湛江 524022,,湛江科技学院, 广东 湛江 524000,,中国林业科学研究院速生树木研究所, 广东 湛江 524022,,中国林业科学研究院速生树木研究所, 广东 湛江 524022,,中国林业科学研究院速生树木研究所, 广东 湛江 524022,,中国林业科学研究院速生树木研究所, 广东 湛江 524022,,江西省林业科技推广和宣传教育中心, 南昌 330033,
关键词:蓝花楹;RAD-seq;遗传多样性;群体遗传
基金:中央级公益科研院所专项资金项目(CAFYBB2019MB004);广东省林业科技创新项目(2018KJCX024)资助
为了解蓝花楹(Jacaranda mimosifolia)种质资源的遗传多样性和群体遗传结构,对168份种质材料进行RAD-seq测序,构建了系统进化树并进行主成分、群体结构和遗传多样性分析。结果表明,比对参考基因组平均比对率为81.02%,平均测序深度23.18×,最终获得45 552个高质量的SNPs。群体遗传结构分析表明,供试蓝花楹可划分为2个大的类群,来自川、渝地区的种质材料基本归为一类;其余地区归为另一类。19个地区的蓝花楹在SNP水平上的遗传多样性较高,云南昆明(YNKM)居群的核苷酸多样性(π)和期望杂合度(He)最大,表现出最高的遗传多样性。因此,来自川、渝地区的蓝花楹具有相对较近的亲缘关系,推断来自同一祖先,而其余地区的种质可能是随机引种栽培。
来源:2022年第5期
《热带亚热带植物学报》期刊编辑部