热带亚热带植物学报

北大核心,CA,JST,CSCD扩展版,WJCI

国内刊号:44-1374/Q

国际刊号:1005-3395

热带亚热带植物学报杂志2022年第3期:碎米荠超氧化物歧化酶基因家族成员的鉴定和分析

发布日期:

作者:付伟,李林,康宇,龙澜,杨永康,殷红清,向极钎,梅磊

单位:恩施土家族苗族自治州农业科学院,湖北 恩施 445000;湖北省富硒产业技术研究院,湖北 恩施 445000,,恩施土家族苗族自治州农业科学院,湖北 恩施 445000;湖北省富硒产业技术研究院,湖北 恩施 445000,,恩施土家族苗族自治州农业科学院,湖北 恩施 445000;湖北省富硒产业技术研究院,湖北 恩施 445000,,恩施土家族苗族自治州农业科学院,湖北 恩施 445000;湖北省富硒产业技术研究院,湖北 恩施 445000,,恩施土家族苗族自治州农业科学院,湖北 恩施 445000;湖北省富硒产业技术研究院,湖北 恩施 445000,,恩施土家族苗族自治州农业科学院,湖北 恩施 445000;湖北省富硒产业技术研究院,湖北 恩施 445000,,恩施土家族苗族自治州农业科学院,湖北 恩施 445000;湖北省富硒产业技术研究院,湖北 恩施 445000,,湖北省富硒产业技术研究院,湖北 恩施 445000;中国科学院植物研究所,北京 100093,

关键词:碎米荠;SOD;基因家族

基金:硒蛋白产业化关键技术研究与应用项目(12602-2-120); 湖北省引进国外人才和智力项目(2020BJH024)资助

为了解碎米荠(Cardamine hirsuta)的SOD基因特征,对SOD家族成员的基因结构、染色体定位、系统进化关系进行了分析,对顺式作用元件和蛋白结构进行了预测,并利用qRT-PCR技术检测各家族成员的组织表达模式。结果表明,碎米荠基因组中共有10个SOD基因(ChSODs),包括6个Cu/Zn-SOD、3个Fe-SOD和1个Mn-SOD。编码的ChSODs蛋白有57~ 324个氨基酸,分子量为6 419.41~34 659.01 kDa,理论等电点为4.92~9.60;系统进化树分析表明,碎米荠的ChSOD与拟南芥的AtSOD的同源性较高;ChSODs在根、茎、叶中均有表达,且在叶中高表达,其中CARHR085500和CARHR256690在叶和茎中表达量较高;顺式作用元件预测表明,碎米荠SOD响应多种非生物胁迫,其中对ABA和低温胁迫较为敏感; ChSODs蛋白质的二级和三级结构具有差异性。这表明碎米荠SOD基因在抗氧化过程中发挥重要作用。

来源:2022年第3期

《热带亚热带植物学报》期刊编辑部

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