热带亚热带植物学报

作者：石登红，王继玥，白禹，张婷，刘燕，欧阳柏成

单位：贵阳学院生物与环境工程学院, 贵阳 550005,,贵阳学院生物与环境工程学院, 贵阳 550005;贵州省山地珍稀动物与经济昆虫重点实验室, 贵阳 550005,,贵州省山地珍稀动物与经济昆虫重点实验室, 贵阳 550005,,贵州省山地珍稀动物与经济昆虫重点实验室, 贵阳 550005,,贵阳学院生物与环境工程学院, 贵阳 550005,,贵阳学院数学与信息工程学院, 贵阳 550005,

关键词：转录组;地果;RNA-seq;差异表达基因

基金：Project of China Scholarship Council (LJF[2017]50863), Program for National Innovation Training of Undergraduate (2018109760007, 2018109760008), Program for First-class Discipline Construction in Guizhou Province (QJKYF[2017]85), Project for Science

为探究地果（Ficus tikoua）的遗传变异特征，利用Illumina HiSeq-2500平台获取地果的基因表达谱。结果表明，共获得了197 362个转录本，总长度和平均长度分别为114 072 125和577 bp。使用BlastX和BlastN共注释了139 992个转录本（占总数的70.93%）。从3个品种叶片和茎的6对样品中，分别鉴定了12 397、12 340、10 373、94 431、71 830和44 465个差异表达基因，以及注释了126、129、125、134、138和137条代谢途径。这将有助于理解地果的遗传特征，以及不同组织中代谢途径的变化。

来源：2020年第4期

《热带亚热带植物学报》期刊编辑部

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