热带亚热带植物学报

北大核心,CA,JST,CSCD扩展版,WJCI

国内刊号:44-1374/Q

国际刊号:1005-3395

热带亚热带植物学报杂志2019年第1期:弯枝藻属rbcL基因的适应性进化分析

发布日期:

作者:韩雨昕,南芳茹,巩超彦,冯佳,吕俊平,刘琪,谢树莲

单位:山西大学生命科学学院, 太原 030006,,山西大学生命科学学院, 太原 030006,,山西大学生命科学学院, 太原 030006,,山西大学生命科学学院, 太原 030006,,山西大学生命科学学院, 太原 030006,,山西大学生命科学学院, 太原 030006,,山西大学生命科学学院, 太原 030006,

关键词:弯枝藻属;rbcL基因;蛋白质结构预测;适应性进化

基金:国家自然科学基金项目(31670208,31370239)资助

为探讨淡水红藻的叶绿体基因及其适应性进化特征,选取弯枝藻属(Compsopogon)及相近外类群的rbcL基因共17条,利用PAML 4.9软件,对弯枝藻属rbcL基因编码蛋白进行生物信息学分析,并分别采用分支模型、位点模型以及分支-位点模型对基因的选择位点进行检测。结果表明,弯枝藻属rbcL基因编码蛋白的二级结构主要由α螺旋和β折叠构成,结构稳定。采用最大似然法构建的系统发育树表明,内类群为单一物种,分为3个小分支,具有一定地理分布规律。在3种进化模型中均未检测到统计上显著的正选择位点,表明绝大多数位点处于负选择压力下。因此,弯枝藻属rbcL基因未发生适应性进化。

来源:2019年第1期

《热带亚热带植物学报》期刊编辑部

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